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宁夏农林科学院首次破译宁夏道地中药材银柴胡染色体水平参考基因组

来源：生物中心作者：甘晓燕日期： 2026-05-11

中药材银柴胡为石竹科繁缕属植物银柴胡（Stellaria　dichotoma）的干燥根，被誉为清虚热、除疳热之良药，临床主治阴虚发热、骨蒸劳热、小儿疳热等症。银柴胡主产于宁夏同心县，是宁夏道地中药材，获国家地理标志保护产品认证，种植面积超2万亩，为区域乡村振兴支柱产业。然而，银柴胡参考基因组序列信息迄今尚未被解析，极大限制了其在抗逆基因挖掘、分子育种等方面的广泛应用。

近日，宁夏农林科学院农业生物技术研究中心团队运用PacBio　HiFi、Hi－C测序数据，对银柴胡野生种质进行了染色体级基因组从头组装，获得1.85Gb基因组；N50序列长度为125.08　Mb，GC含量为37.55％，包含48，391个蛋白编码基因；BUSCO评估组装完整性为95.66％。最终成功组装14条染色体，LAI指数为17.04。相关研究成果发表在国际知名期刊Frontiers　in　plant　science（中国科学院二区，影响因子4．8）上，题目为“Chromosome－level　genome　assembly　of　Stellaria　dichotoma　reveals　extensive　transposable　element　proliferation　in　a　traditional　Chinese　medicinal　plant”。

该研究由自治区重点研发计划项目课题“道地药材银柴胡基因组图谱分析及特异性分子标记开发与应用”资助，依托植物生物育种宁夏重点实验室、宁夏农业生物技术研究科技创新团队及宁夏农业生物技术研究专家服务站，率先完成了银柴胡染色体水平高质量参考基因组的组装与分析，为推动银柴胡遗传背景解析、药用植物种质创新与开发利用、功能活性成分生物合成等研究奠定了重要基础。

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